Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pdzd4Q9QY39 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzd4Q9QY39 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pdzd4Q9QY39 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pdzd4Q9QY39 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pdzd4Q9QY39 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pdzd4Q9QY39 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pdzd4Q9QY39 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdzd4Q9QY39 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdzd4Q9QY39 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdzd4Q9QY39 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzd4Q9QY39 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms