Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ASCL3Q9NQ33 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms