Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfmbt1Q9JMD1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms