Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn6Q9JMB8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms