Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SrfQ9JM73 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SrfQ9JM73 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrfQ9JM73 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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