Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rabgef1Q9JM13 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rabgef1Q9JM13 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms