Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col5a3Q9JLI2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms