Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hmgn5Q9JL35 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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