Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms