Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Tmod2Q9JKK7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmod2Q9JKK7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms