Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uchl3Q9JKB1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uchl3Q9JKB1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms