Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc86Q9JJ89 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc86Q9JJ89 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms