Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tm9sf3Q9ET30 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms