Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pgpep1Q9ESW8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pgpep1Q9ESW8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pgpep1Q9ESW8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pgpep1Q9ESW8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pgpep1Q9ESW8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pgpep1Q9ESW8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pgpep1Q9ESW8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Pgpep1Q9ESW8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms