Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tfip11Q9ERA6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms