Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clstn2Q9ER65 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Clstn2Q9ER65 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms