Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SgshQ9EQ08 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms