Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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