Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fundc1Q9DB70 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fundc1Q9DB70 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms