Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prpf4Q9DAW6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms