Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgf29Q9DA08 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgf29Q9DA08 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms