Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rsph9Q9D9V4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms