Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calr3Q9D9Q6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calr3Q9D9Q6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calr3Q9D9Q6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calr3Q9D9Q6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calr3Q9D9Q6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calr3Q9D9Q6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calr3Q9D9Q6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms