Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot8Q9D8X5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms