Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Snx5Q9D8U8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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