Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Q9D8Q6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Q9D8Q6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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