Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc52a2Q9D8F3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc52a2Q9D8F3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms