Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp2c55Q9D816 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms