Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klhl40Q9D783 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms