Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc9bQ9D6E4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc9bQ9D6E4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc9bQ9D6E4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc9bQ9D6E4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc9bQ9D6E4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc9bQ9D6E4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms