Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sdr42e1Q9D665 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdr42e1Q9D665 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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