Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ccdc39Q9D5Y1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc39Q9D5Y1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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