Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn11Q9D572 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms