Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms