Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrnp35Q9D384 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms