Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6bQ9D289 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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