Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl53Q9D1H8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms