Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ddx56Q9D0R4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ddx56Q9D0R4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ddx56Q9D0R4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx56Q9D0R4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx56Q9D0R4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx56Q9D0R4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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