Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ndc80Q9D0F1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ndc80Q9D0F1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ndc80Q9D0F1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ndc80Q9D0F1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ndc80Q9D0F1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ndc80Q9D0F1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndc80Q9D0F1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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