Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Shisa9Q9CZN4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms