Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc18Q9CZJ9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms