Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssu72Q9CY97 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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