Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkrip1Q9CWV6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms