Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Tdrd12Q9CWU0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tdrd12Q9CWU0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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