Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rprd1bQ9CSU0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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