Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snw1Q9CSN1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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