Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CactinQ9CS00 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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