Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sec61bQ9CQS8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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