Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdm1Q9CQK3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdm1Q9CQK3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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