Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rwdd4Q9CPR1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd4Q9CPR1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms